STR
        微衛星標記(Microsatellite)也稱為短串聯重復序列(STR)或簡單重復序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復序列,一般由一個長2~6bp的核心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間。微衛星中重復單位的數目存在高度變異,這些變異表現為微衛星數目的整倍性變異或重復單位序列中的序列有可能不完全相同,因而造成多個位點的多態性。SSR標記能很好地將這些變異揭示出來,不同的SSR在不同的種甚至不同個體間的多態性。由于基因組中某一特定的微衛星的側翼序列通常都是保守性較強的單一序列,因而可以將微衛星側翼的DNA片段克隆、測序,然后根據微衛星的側翼序列就可以人工合成引物進行PCR擴增,從而將單個微衛星位點擴增出來。由于單個微衛星位點重復單元在數量上的變異,個體的擴增產物在長度上的變化就產生長度的多態性,這一多態性稱為簡單序列重復長度多態性(SSLP),每一擴增位點就代表了這一位點的一對等位基因。由于SSR重復數目變化很大,所以SSR標記能揭示比RFLP高得多的多態性。STR分型高效快捷,結果精確,是非常重要的遺傳標記,在基因定位、遺傳育種等領域有著廣泛的應用。

服務訂購

項目類型

STR遺傳標記分析服務價格

位點調試費

位點檢測費

STR分型

300元/位點

5元/位點/樣本


檢測技術

        微衛星位點通常通過PCR擴增和電泳檢測,并根據片段大小分離等位基因進行分析;擴增后的等位微衛星可以用多種方法檢測,傳統方法采用聚丙烯酰胺凝膠電泳加放射顯影或銀染的方法,費時費力效率低。利用ABI遺傳分析儀對熒光標記的DNA片段進行檢測,結合分子量內標進行DNA片段長度計算,使STR分型變得高效快捷,結果也更加精確。基于測序儀平臺,我公司同時提供的全套微衛星(STR、SSR)分型服務,包括MSI、LOH分析等。

實驗流程

1. 實驗方案的設計,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記、內標的選用等。
2. 預實驗:確定PCR反應條件。
3. 正式實驗:完成熒光PCR,并在測序儀上完成電泳掃描,數據采集,去掉低值數據,分析結果、補充測序、完成分析。
4. 對收集的數據進行處理分析,提供產物片段大小、數量多少的信息數據。

樣品要求

1、DNA樣品:濃度≥50ng/ul、體積≥20ul的總DNA樣品,DNA抽提:血液20元/樣本;新鮮組織30元/樣本;石蠟包埋組織50元/樣本;
2、血液樣品:請提供≥500ul抗凝血;采用標準的采樣管,抗凝劑推薦使用EDTA;
3、組織樣品:請提供足量的組織樣品(≥300mg);
4、細胞(≥106 );
5、STR位點信息: STR位點上下游各200bp的確切序列及STR位點的信息;

提供結果

1. 實驗過程及其涉及的電泳圖、測序峰型圖;
2. 擴增和反應體系所設計的引物序列;
3. 客戶所需的其他資料。

參考資料
1. Sun at all.Genome-Wide Characterization and Linkage Mapping of Simple Sequence Repeats in Mei (Prunus mume Sieb. et Zucc. )
2. 張睿婷,韓之波,王 濤,孟 磊,劉志鵬,李 奎,及月茹,楊洲鑫,李揚秋,韓忠朝.人胎盤絨毛膜來源間充質干細胞的生物學特性.中國組織工程研究與臨床康復,2011,15(10):1823-1826.
3. Kui LIU, Kai FENG, Ping WANG, Hai-ying JIA, Jia-ting REN, Hao-jun LU, Wen-hong PENG.Relationship of the aquaporin-5 gene polymorphism with chronic obstructive pulmonary disease in Han population of north China.
4. 匡猛等, 2011, 基于棉花SSR的多色熒光標記檢測技術, 分子植物育種Vol.9 No.31 (doi:10.5376/mpb.cn.2011.09.0031).
5. Yimei Wang.Induced Pluripotent Stem Cells from Human Hair Follicle Mesenchymal Stem Cells.Published online: 16 December 2012 # The Author(s) 2012. This article is published with open access at Springerlink.com.
6. Nopparat Buahom, Yu Du, Yi Wu, Yuliang Deng, Xiaolong Jiang, Wei Fu, Zhihong Li. Polymorphic microsatellite markers in the guava fruit fly, Bactrocera correcta (Diptera: Tephritidae).
7. Xiang-Qin Yu, Qiao-Ming Li. Isolation and characterization of microsatellite markers for a worldwide invasive weed, Chromolaena odorata(Asteraceae). 7.Construction of a primary DNA fingerprint database for cotton cultivars. Genetics and Molecular Research 12 (2): 1897-1906 (2013).
服務訂購
訂購信息
下載產品訂購表或產品訂購合同并按要求填寫后發送至[email protected],公司收到訂單或產品訂購合同會及時與您回復及確認,并安排相關人員生產發運。
  • 訂單或合同下載 為保證您的訂單或訂購合同順利上傳,請您下載最新訂單或訂購合同。
  • 電話: 400-900-3669; 0550-3721098
  • 傳真:0550-3721086
在線客服
nba赛事